本作也是基于PSP版《英雄传说：空之轨迹SC》进行高清化，并且追加主剧情的全程语音，同时游戏的动画和事件插图也将重新绘制，前作中追加的好评的系统也会在本作中继续采用。

游戏系统

连锁战技系统

连锁战技可使战技威力提升。在游戏中追加了可以让2个以上角色一起使用连锁技的“连锁技系统”。连锁技的使用方法和普通的战技一样，而且可以让已经行动过的伙伴再次通过连锁技展开攻击，这让游戏中的战略性变得更加灵活。

另外，游戏还设置自由的队伍组合战术。前作中队伍的人员组合都是固定的，这一点在SC中将得到改变——队伍的人员组织可以根据自己喜好来编排。在一些很细小的事件当中，人物之间的对话也会因参与的角色不同而不同，所以这也是续作的一大特色。当然，玩家对角色的了解也会进一步加深，所以想领会更多有趣的情节，游戏并不是玩一次两次就能完全体会到的。另外，在战斗中也可以和“连锁战技”结合起来，享受到和角色组合一样多的战术。

导力魔法系统

相比前作《英雄传说：空之轨迹FC》新增34种，出现空系幻系攻击魔法。

导力器结构、结晶孔等级

结晶孔由6孔增至7孔，可以升级为2级、3级。在SC中，给各个角色的导力器安装了某种属性的『结晶回路』之后，除了角色相应的能力可以得到强化以外，还可以使用导力魔法(Orbal Arts)。

SC中的所有角色使用的导力器都与前作的不同，因为他们身上的导力器中增加了一个结晶孔的新型导力器。由此，结晶回路的种类也变得丰富起来了，众多新式强劲的魔法也会随之登场。

在新型导力器中，各个结晶孔都有等级设定，对其进行强化升级之后，就可以安装SC中追加的新型高性能的结晶回路了。

钓鱼系统

在本作中新增的全新“料理系统”和各种地方能享受钓鱼的“钓鱼系统”，无论哪种都会给冒险带来更多的乐趣。

根据钓竿的不同能使用的鱼饵也不同，鱼饵可以通过与魔兽的战斗中获得。每种鱼对鱼饵的需求也不同。

料理系统

本作相较前作，料理更有个性，并且新增战斗中使用的攻击料理。料理手册中全部的料理附有图解说明，使料理更有乐趣。

游击士任务系统

正游击士徽章游击士协会会收到各种各样的委托任务。任务的类型多种多样，不单是在城镇里面完成的任务，而且还有需要到诸多地点去调查的任务，以及和强大的魔兽交战的任务。时不时地调查一下公告板，就可以在进行主线的同时顺便游刃有余地完成这些委托任务。